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揭秘单细胞测序黑马BD的5大隐藏技能

BD Rhapsody™


世界知名的老牌医疗技术及医疗设备公司BD(Becton, Dickinson and Company)推出的BD Rhapsody™ 单细胞分离捕获系统,凭借其特色细胞捕获质控方案和灵活的产品组合选择,一经问世,便引起业界的关注。

BD Rhapsody™ 平台部分发表文献


BD Rhapsody™平台采用微孔捕获技术,蜂巢板上设有20多万以上的微孔,其数目远超细胞数量,可以在最大程度上避免微孔之间的串扰和降低多细胞率。

BD Rhapsody™ 单细胞分选原理

虽然看似简单,但是这里面隐藏着5大玄机,接下来小编为你一一解析。


技能1:实验过程可视


不同于10x Genomics必须要等到测序数据下机后才能知道捕获细胞数目,BD Rhapsody™­在实验过程便可以通过Scanner仪器清楚看到真实的捕获细胞,甚至还提供了细胞捕获质控结果。规避了其他单细胞平台上机后只能蒙头朝下走的弊端,可以在实验早期发现问题,及时纠正。

左图为Scanner仪器,中图为蜂巢板扫描结果,右图为质控结果


技能2:细胞活性要求低


上机难一直是10x Genomics的一大弊端,要求细胞活性必须达到85%以上,想必很多研究病理或者特殊类型样本的老师对此很是头疼。


BD Rhapsody™­蜂巢板技术是依靠细胞重力自由沉降,避免了10x Genomics中存在的概率碰撞,所以对于起始细胞活性要求较低,细胞活性达到60%即可上机。

技能3:靶向panel


与WTA测定相比,它可提供成本更低、灵敏度更高的低丰度转录产物检测。采用靶向基因表达测定,可以去除过度测序带来的高昂测序成本。

技能4:BD™ AbSeq


BD™ AbSeq可通过高通量测序来分析单细胞水平的蛋白表达,将高质量抗体和寡核苷酸结合在一起,使研究人员能够在BD Rhapsody™单细胞分析平台上开展单细胞蛋白分析,同时分析数千个单个细胞中的RNA和蛋白质,完整揭示出基因和蛋白在生物系统中的作用。

BD™ AbSeq工作流程


技能5:单细胞多路分析试剂盒


BD™ 单细胞多路分析试剂盒利用寡核苷酸偶联抗体为单细胞3’RNA-seq 测定提供高样本通量。试剂盒中的抗体,能够靶标遍在表达的细胞表面抗原。每个抗体均与一个样本标签相结合,一次最多可以混合12个样本上机,可以显著降低项目成本。同时,通过样本标签可以识别和移除来自不同样本的错误数据,改善数据质量。

两个样本的PBMC混样结果数据


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