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代谢组学策略及SCI文章解析—农业篇 
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什么是LM精准靶向代谢组学?


小问


小鹿


LM精准靶向代谢组学可对感兴趣的目标代谢物,提取标准品的离子对和保留时间等信息。通过MRM模式采集生物样本代谢组数据,实现代谢物的绝对定性。并且结合外标定量法,利用标准品的标准曲线,实现样品中代谢物的绝对定量

什么是非靶向代谢组学?



小问


小鹿


简单来说是非目标代谢组学或发现代谢组学,无偏向性地对样本中能检测到的所有代谢物进行检测分析,获得待检样本中代谢物的相对定量上的差异,通过差异化合物去研究生物学问题。

什么是广泛靶向/拟靶向/类靶向代谢组学?


小问



小鹿



广泛靶向/拟靶/类靶向技术根据部分标准品打出的质谱碎片进行提取离子,同时结合公共数据库进行代谢数据的解析,从而建立一个本地数据库;根据目标代谢物,调取本地数据库中的离子对等信息,采用MRM模式采集生物样本代谢组数据,实现对代谢物的定性和相对定量


还不明白?就看看下面这张图吧~



代谢组技术区别.jpg

看完之后对于LM精准靶向代谢组学/非靶向代谢组学/广泛靶向/拟靶向代谢组学是不是有了清晰的了解~




问题一


鹿明生物的LM精准靶向代谢组学和非靶向代谢组学是如何助力科研的呢?




问题二


鹿明生物针对代谢组学常用数据库有哪些?详见下表~~





问题三



相信有童鞋又有疑问了?非靶向代谢组学是如何与LM精准靶向代谢组学结合的呢?


GC-MS和LC-MS两种平台各有优势,主要是由目标化合物的理化性质决定,GC-MS平台适合易挥发性、分子量不太大的化合物。LC-MS平台适合中等或强极性的化合物,分子量范围广。目前由于分析技术上的局限性,尚未产生出一种分析技术可以精确描述样本内所有可能的化合物。


通过LC-MS或GC-MS技术平台鉴定尽可能多的代谢物,筛选差异代谢物,结合统计分析、功能分析、过往研究和文献寻找目标代谢物。


利用LM精准靶向代谢组学,对目标代谢物进行精准靶向验证,实现绝对定性和绝对定量


因此非靶向代谢组学和LM精准靶向代谢组学技术的强强结合,是研究代谢组学相对完善的技术组合。


LM精准靶向仪器介绍

仪器:

Sciex Qtrap6500 Plus


主要技术指标:

1、定量分析灵敏度高(MRM模式):

ESI离子源 1 pg 利血平(Reserpine)柱上进样 ,信噪比S/N≥510000:1

2、定量分析动态范围广:动态线性范围> 106

3、定量重复性好:定量重复性<5%

1、 产生更多离子的离子源技术:

新一代 IonDrive Turbo V 离子源使用增强的气流动力学和优化的加热器配置提高了离子化效率以及系统的可靠性、重现性。

2、 聚焦和传输更多离子的离子传输技术:

重新优化并获得专利的 IonDrive QJet 导向器通过多级设计改善了离子容量和碰撞聚焦,可以更有效地捕获和聚焦离子。

3、 检测更多离子的检测器技术:

全新的 IonDrive 高能检测器+ 采用先进的浮动设计,能够以更高灵敏度检测范围更广的化合物。


备注:本仪器适用于液质联用LM精准靶向代谢组学


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