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单细胞转录组高通量测序是研究哺乳动物单细胞的常用方法，被广泛用于研究动物细胞组织分子异质性、细胞发育进程及稀有细胞类型鉴定等。随着液滴技术的发展和自动化程度的提高，单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）的通量逐渐增高，并且在动物中被普遍使用，但在将其应用于植物时，诸如打破细胞壁的必要性（随后的转录效应）、高渗压敏感性和高细胞尺寸变异性等技术难题，仍然是植物单细胞面临的潜在挑战。
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