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随着近年来人们越来越多的认识到代谢研究的重要性，自1998年“代谢组学”概念提出以来，每年发表的研究文章数量都在不断增加。代谢组学在生命科学和医药研究中也得到更为广泛的应用，包括细胞代谢调控、代谢新通路、疾病代谢机制、药物新靶标发现与确证、药物药效及毒性评价、疾病诊断或预后生物标志物、药物代谢组学、精准用药等领域。代谢组学拥有极其广泛和重要的应用前景，是一门充满朝气的学科。
代谢组是指细胞在特定生理时期内所有的低分子量代谢产物总和，代谢组能让我们全面理解一个生物系统，它能为研究者提供许多功能性信息。
如果说基因组学和蛋白质组学告诉我们可能发生的事件，那么代谢组学则可以告诉我们已经发生的事件。到目前为止人体内究竟有多少种代谢产物还很难说清楚，但包括脂肪、糖、氨基酸在内的各种底物以及代谢过程中生成的小分子化合物能够为了解机体健康状态提供重要信息。
代谢组学的研究简单快捷、耗费较低、容易得出许多功能信息，由于代谢产物存在于任何组织、细胞、血、尿液、唾液等体液中，因此这种方法对临床标本的检测最为实用。
从研究目的和方法的角度看，通常可将代谢组学分为非靶向代谢组学和靶向代谢组学两种类型。非靶向代谢组学致力于尽可能全面地对生物体系中的所有内源性小分子代谢物进行系统分析，而靶向代谢组学则更侧重于针对科研人员所感兴趣的一组特定的代谢物进行分析。分析手段方面，代谢组学主要采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）、气相色谱-质谱联用（GC-MS）等分析平台。
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