这个R包不太冷-课程内容导学篇

课程介绍：

这么多精美的图想自己一把全学会吗？放下奶茶，我们一起来看看发表在各大期刊的科研图都啥样吧

1.发表期刊：BMC Bioinformatics

文章标题：Enrichr: interactive and collaborative HTML5 gene list enrichment analysis tool

科研图片：复合热图/热图组合

2.发表期刊：Nucleic Acids Research

文章标题：Enrichr: a comprehensive gene set enrichment analysis web server 2016 update

科研图片：复合韦恩图

3.发表期刊：BMC Biology

文章标题：The human microbiome in evolution

科研图片：复合点图或组合图

4.发表期刊：Neuron

文章标题：Thrombospondin-1 Mediates Axon Regeneration in Retinal Ganglion Cells

科研图片：

（1）“红与黑”柱形图

（2）“红与蓝”火山图

5.发表期刊：Genome Biology

文章标题：SCoPE-MS: mass spectrometry of single mammalian cells quantifies proteome heterogeneity during cell differentiation

科研图片：精美PCA

看到上面精美的图，相信大家迫不及待想要get这个技能、想要立刻上手制作SCI级别的科研美图。千里之行始于足下，想要做成上面的科研好图，让我们一起来解锁易明学院这个R包不太冷系列课程。

一起来“康康”这个R包不太冷系列都有啥？

关键词：0基础、SCI文献级气泡图、即学即会

讲师介绍：甜橙诚：易明学院高级讲师，代谢组学生物信息分析工程师，毕业于生物信息学专业，有多年生物信息分析经验，有RNA-seq,ChIP-seq分析背景,能够熟练使用R语言和Linux操作系统进行生信分析，擅长使用R来进行数据统计分析和绘图操作，例如对数据进行T检验、聚类分析、超几何分布富集分析等，能够绘制气泡图、箱型图、热图、火山图等一系列生信分析中常见图形。能熟练使用Adobe Illustrator对图片进行调整排版和绘制代谢的机制图、模式图，能够结合R和AI对图形进行修饰优化。在LC-MS和GC-MS数据处理和定性定量分析上有丰富的经验。

课程介绍：本节课程主要带领大家运用R语言的ggplot2包，绘制SCI文献级别的富集分析气泡图。ggplot2可以将所绘制图形的各部分独立出来，每一部分分别用一段代码表示，各代码段再通过“+”运算符连接。富集分析是将基因根据先验的知识（也就是常见的注释）进行分类的过程，最常见的富集分析是GO与KEGG富集，在一些高分文献中会使用高效的气泡图（Bubble图）来展示富集分析结果。气泡图属于散点图的一种，它是在散点图的基础上改变点的形状，大小和颜色。富集分析气泡图是在笛卡尔坐标系中加入数量、p值等参数表示三个变量关系的图形。在对基因完成GO/KEGG分析后，使用气泡图可以直观的展示pathway、p-value、count之间的关系，能够更加全面而详细地可视化富集分析结果。

关键词：全网种类最全的小提琴图、0基础入门、长期的课后解答

讲师介绍：北极星：易明学院优秀讲师，专注于生物信息学分析，有单细胞转录组学分析背景，现在专门致力于蛋白组学生信分析，主要擅长解决分析报告中图形展示优化的问题；以及各种生物学功能注释数据库更新和使用；擅长运用Linux Shell编程、R和Python语言及各种软件工具解决生物信息学相关问题。

课程介绍：本节课程主要带领大家学习R绘制小提琴图原理、方法以及相关绘图R包和函数的运用，还涉及颜色的选择的方法和需注意的问题。R包不太冷-小提琴图篇课程主要有以下亮点：
（1）本视频课程主要讲解如何使用R语言绘制样式繁多的小提琴图（全网种类最全的小提琴图），还涉及小提琴图的个性化参数设置；
（2）讲师带领学员快速理解R绘制小提琴图的原理和技巧；
（3）课程的实操演示和绘图代码会直接提供给学员，帮助学员快速上手R绘制小提琴图；
（4）长期有效的课程售后：后期的课程问题解答，解决学员学习R绘制小提琴图中的所有问题，直到学员满意为止。

关键词：聚类热图、数据可视化、个性化热图绘制

讲师介绍：北极星老师，同上介绍

课程介绍：聚类热图是生信分析中常见的一种数据可视化方法，可以对比较组之间的基因、蛋白和代谢物进行比较分析，也可以发现基因、蛋白或代谢物的时空表达模式，对样品聚类可以发现相似或相近的样品，对基因、蛋白或代谢物聚类可以找到相同或相反的表达Cluster模块。这个R包不太冷系列课程热图篇主要讲解使用pheatmap包进行个性化热图绘制，包括各个重要参数的用法说明以及个性化参数的调整，最后讲解如何使用各参数进行组合绘制出个性化的聚类热图，有数据有图有代码，可以帮助您快速学会个性化聚类热图的绘制。

关键词：时间序列分析、mfuzz包、软聚类分析、动力学特征呈现

讲师介绍：子路：易明学院优秀讲师、高级生信工程师，3年生信分析经历，在生物数据分析及R、python等多种语言编程绘图方面有着丰富的经验。通过自身的学习经历带大家由浅入深的走进生信分析的领域。

课程介绍：本节课程为大家带来使用mfuzz包对表达量数据进行软聚类分析，比如时间分析，趋势分析的变化趋势的展示。Mfuzz还集作图功能于一身，除了实现表达谱的聚类外，还能绘制时间序列，清晰地为我们呈现表达的动力学特征。

关键词：盒图、箱线图、数据分布、轻松学习

讲师介绍：百香果：易明学院高级讲师；蛋白质组学高级分析工程师，5年生信历程，精通R语言统计分析及数据可视化，例如T检验、方差分析、和弦图、气泡图等。

课程介绍：盒图（Boxplot）也称箱线图，它是用一组数据中的最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数和最大值来反映数据分布的中心位置和散布范围，可以粗略地看出数据是否具有对称性。通过将多组数据的箱线图画在同一坐标上，则可以清晰地显示各组数据的分布差异，为发现问题、改进流程提供线索。

关键词：Venn图、VennDiagram包、个性化作图

讲师介绍：阿纳：易明学院高级讲师；代谢生物信息分析高级工程师，擅长于GC-MS普筛的定性、数据处理分析和数据库整理更新。在GC-MS普筛数据分析.在生物数据分析,R,python上有丰富经验。

课程介绍：课程大纲：1、介绍常见的多种venn图的作图工具和网站;2、使用R语言VennDiagram包绘制venn图; 3、优化和个性化图片相关参数设置

关键词：被生信耽误的诗人讲师、PCA图、组内和组间差异分析

讲师介绍：权权：易明学院优秀讲师，幽默风趣，课程有一种自带气质性幽默特色；一个被生信耽误的诗人。专注生信分析,熟练运用R,shell语言，有丰富python经验，精研数据分析，机器学习领域。

课程介绍：主成分分析PCA(Principal components analysis)，是一种简化数据的技术，经常用于减少数据集的维数，同时保持数据集中的对方差贡献最大的特征，有着广泛的运用，常应用在文本处理、人脸识别、图片识别、自然语言处理等领域。生信分析过程中可以通过PCA反映组内和组间差异,是在质控过程中必不可少的步骤。
课程内容：
1、PCA的原理介绍
2、基于蛋白组数据集,运用R语言绘制PCA图
3、PCA的其他应用介绍

关键词：被生信耽误的诗人讲师、PCA图、组内和组间差异分析、逻辑回归、随机森林

讲师介绍：小笼包：易明学院高级讲师，有机器学习和人工智能项目背景，专注于蛋白质组学生信分析，擅长使用R语言进行数据处理及可视化绘图。

课程介绍：ROC曲线全称接受者操作特性曲线，ROC曲线上每个点反映着对同一信号刺激的感受性，是现在使用最广泛，认可度最高的二分类器衡量指标，画出分类器的ROC曲线，就可以直观地感受分类器的优劣。本次课程主要带领大家了解ROC曲线原理和如何利用R语言绘制ROC曲线。
R包不太冷-ROC曲线篇课程能够帮助学员解决以下困扰：
（1）对算法原理一知半解，什么样的算法适用于什么样的数据根本分不清
（2）有很多适合的算法该用哪一种呢？是逻辑回归，随机森林，还是朴素贝叶斯，神经网络，到底哪一种算法更能拟合自己的数据集，生成效果很好的分类器呢？
掌握分类器评价指标，自然可以实现分类器的选择。

这么干货的系列课程怎么收费呢？

本次全面干货的R系列课程保底16节课，后面将不断更新，目前已上新4节课程，10月底将上新5节，明年上半年将持续更新至16节。原线下1599元的课程，我们也是趁此节日大放送，不要1599元，也不用999元！这个系列课只需原价699元！不仅如此，趁此佳节，特批提前预售价399元；平均一杯奶茶钱即可兑换成干货满满的一节课，全面助力您的科研绘图；划不划算？一杯奶茶换1篇SCI文章科研图简直不要太划算了呢！OMG，买它！！！预售期9月28日-10月31日；错过不再有哦~

预购本次系列课程可享受的福利/权益：

1）全系列课程软件包、工具、代码及课件全部享有；

2）随时随地回复的VIP社群服务，授课讲师专门辅导及答疑；

3）享有易明学院积分400个鹿币计入您的账号，鹿币可兑换周边好礼哟；

4）可获取一本干货书籍《R语言实战(第2版)》，电子书与线上课全面打通您的R语言绘图；

5）可以为您开具电子发票。

课表目录：

下图为10月底前会更新到本系列课程的内容；2021年5月前将再在此基础上更新至16节，后续将持续更新。欢迎报名参加~

通过这个课程能学会什么？

这么多精美的图想自己一把全学会吗？放下奶茶，我们一起来看看发表在各大期刊的科研图都啥样吧

1.发表期刊：BMC Bioinformatics

文章标题：Enrichr: interactive and collaborative HTML5 gene list enrichment analysis tool

科研图片：复合热图/热图组合

2.发表期刊：Nucleic Acids Research

文章标题：Enrichr: a comprehensive gene set enrichment analysis web server 2016 update

科研图片：复合韦恩图

3.发表期刊：BMC Biology

文章标题：The human microbiome in evolution

科研图片：复合点图或组合图

4.发表期刊：Neuron

文章标题：Thrombospondin-1 Mediates Axon Regeneration in Retinal Ganglion Cells

科研图片：

（1）“红与黑”柱形图

（2）“红与蓝”火山图

5.发表期刊：Genome Biology

文章标题：SCoPE-MS: mass spectrometry of single mammalian cells quantifies proteome heterogeneity during cell differentiation

科研图片：精美PCA

预购本次系列课程可享受的福利/权益：

1）全系列课程软件包、工具、代码及课件全部享有；

2）随时随地回复的VIP社群服务，授课讲师专门辅导及答疑；

3）享有易明学院积分400个鹿币计入您的账号，鹿币可兑换周边好礼哟；

4）可获取一本干货书籍《R语言实战(第2版)》，电子书与线上课全面打通您的R语言绘图；

5）可以为您开具电子发票。