蛋白质互作网络是由单独蛋白通过彼此之间的相互作用构成，来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系，对于了解生物系统中蛋白质的工作原理，了解疾病等特殊生理状态下生物信号和能量物质代谢的反应机制，以及了解蛋白之间的功能联系都有重要意义。
蛋白质相互作用通常可以分为物理互作和遗传互作。物理互作是指蛋白质间通过空间构象或化学键彼此发生的结合或化学反应，是蛋白质互作的主要研究对象。而遗传互作则是指在特殊环境下，蛋白质或编码基因收到其他蛋白质或基因的影响，常常表现为表型变化之间的相互关系。蛋白质互作网络包括:蛋白质互作检测技术(免疫共沉淀技术、酵母双杂交技术、串联亲和纯化-质谱分析技术、蛋白质互作预测技术、遗传互作检测技术)蛋白质互作数据库、蛋白质互作网络。
